Molekulāri bioloģiskās laboratoriskās tehnoloģijas

Nr.p.k.

Testēšanas objekts

Izmeklējamais rādītājs

Izmeklēšanas metode, princips

Tehnoloģijas kods

1.

Asins serums

B hepatīta DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 001

2.

Asins plazma

B hepatīta DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 002

3.

Asins serums

C hepatīta vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 003

4.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 004

5.

Asins serums

C hepatīta vīrusa RNS, kvantitatīvi

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 005

6.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa RNS, kvantitatīvi

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 006

7.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis antigēns

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 007

8.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Chlamidia trachomatis antigēns

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 008

9.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis DNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 009

10.

Urīns

Chlamidia trachomatis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 010

11.

Urīns

Chlamidia trachomatis DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 011

12.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Chlamidia trachomatis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 012

13.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Chlamydia trachomatis ribosomālās RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 013

14.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 014

15.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 015

16.

Muguras smadzeņu šķidrums

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 016

17.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 017

18.

Urīns

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 018

19.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

FRAXA lokusa mutācija

Polimerāzes ķēdes reakcija+elektro-forēze

La/ MoB 019

20.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

G 272X

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 020

21.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

Herpes simplex vīrusu 1., 2. tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 021

22.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 022

23.

Muguras smadzeņu šķidrums

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 023

24.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Herpes simplex vīrusu I, II tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 024

25.

Asins plazma ar anti-koagulantu EDTA

HIV 1 vīrusa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 025

26.

Asins plazma ar antikoagulantu EDTA

HIV 1 vīrusa RNS, kvantitatīvi (vīrusa slodze)

Kvantitatīva polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 026

27.

Asinis ar anti-koagulantu

HLA - B27 antigēna noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 027

28.

Asinis ar anti-koagulantu

HLA I un II klases antigēnu tipēšana

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 028

29.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

IV 10 nt 546

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 029

30.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

K 329 E

Polimerāzes ķēdes reakcija 1, polimerāzes ķēdes reakcija 2  D17+ elektroforēze

La/ MoB 030

31.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Mycoplasma hominis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 031

32.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 032

33.

Urīns

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 033

34.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 034

35.

Urīns

Neisseria gonorrhoeae mērķa DNS

Ligāzes ķēdes reakcija

La/ MoB 035

36.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseria gonorrhoeae mērķa RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 036

37.

Uztriepe no dzimum-orgāniem

Neisseriae gonorrhoeae ribosomālās RNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 037

38.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimumorgānu) un nokasījumi

Papillomas vīrusi

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 038

39.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimum-orgānu) un nokasījumi

Papillomas vīrusu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 039

40.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Papillomas vīrusu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 040

41.

Biopsijas un sekcijas materiāli

Papillomas vīrusu DNS

DNS/RNS hibridizācijas metode

La/ MoB 041

42.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 252 W

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 042

43.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 261 Q

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 043

44.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

R 408 W

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)+restrikcijas analīze+elektro-forēze

La/ MoB 044

45.

Uztriepes (rīkles gala, deguna eju, konjunktīvas, dzimum-orgānu) un nokasījumi

Ureaplasma urealyticum DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 045

46.

DNS

Gēnu mutāciju selektīvais skrīnings

Polimerāzes ķēdes reakcija, elektrofoēze

La/ MoB 046

47.

DNS

SMA gēna mutāciju noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija, elektrofoēze

La/ MoB 047

48.

DNS

Fragilā X sindroma mutāciju noteikšana

Sauzerna blotings, izmantojot neradiaktīvas iezīmes

La/ MoB 048

49.

DNS

VNTR sistēma FAH gēna

VNTR (minisatelītu) sistēmas analīze ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforāzi)

La/ MoB 049

50.

DNS

STR sistēmu FAH gēnā

STR (minisatelītu) sistēmas analīze ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforāzi)

La/ MoB 050

51.

DNS

Y hromosomas delēcijas

Y hromosomas delēciju noteikšana (Promega System, Version 1.1) ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforēze)

La/ MoB 051

52.

DNS

Paternitātes noteikšana

GenePrint®Silver STR®III sistēma ar polimerāzes ķēdes reakciju (elektroforēze)

La/ MoB 052

53.

Bioloģiskais materiāls

Citomegalovīrusa DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 053

54.

Bioloģiskais materiāls

Herpes simplex vīrusa DNS

DNS hibridizācijas metode

La/ MoB 054

55.

Bioloģiskais materiāls

Varicella zoster vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 055

56.

Bioloģiskais materiāls

Epšteina - Barra vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 056

57.

Bioloģiskais materiāls

Enterovīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 057

58.

Bioloģiskais materiāls

JC vīrusu (Polyomavirus) DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 058

59.

Bioloģiskais materiāls

6.tipa cilvēka Herpesvīrusa (HHV-6) DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 059

60.

Bioloģiskais materiāls

Toxoplazma gondii DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 060

61.

Bioloģiskais materiāls

C. diphtheriae RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 061

62.

Bioloģiskais materiāls

Cryptococcus neoformans DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 062

63.

Bioloģiskais materiāls

Borrelia burgdorferi DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 063

64.

Bioloģiskais materiāls

HIV 1 vīrusa RNS

Ligāzes ķēdes reakcija (LCR)

La/ MoB 064

65.

Bioloģiskais materiāls

HIV genotips

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) + lineāra imūnfermentatīva reakcija (LIA)

La/ MoB 065

66.

Asins plazma

C hepatīta vīrusa DNS genotipēšana (HCV genotipēšana)

Polimerāzes ķēdes reakcija un imunoblots (PCR, imunoblots)

La/ MoB 066

67.

Asins serums

C hepatīta vīrusa DNS genotipēšana (HCV genotipēšana)

Polimerāzes ķēdes reakcija un imunoblots (PCR, imunoblots)

La/ MoB 067

68.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

STR (īsie fragmentu atkārtojumi) genotips Paternitātes un personas identifikācijas noteikšana

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS fragmentu
analīze ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 310 izmantojot reaģentu komplektu AmpFISTR®
Identifiler™

La/ MoB 068

69.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutāciju klātbūtne gēnā F8
Hemofīlijas A DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 069

70.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutāciju klātbūtne gēnā F9
Hemofīlijas B DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 070

71.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

4 mutāciju klātbūtne gēnā BRCA1: 5382insC, 185delAG, 300T>G, 4154delA
Iedzimta krūts un olnīcu vēža DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS fragmentu analīze, DNS sekvenēšana 
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 071

72.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas C(677)T klātbūtne gēnā MTHFR(metilēn-tetrahidrofolāta reduktāze)
Trombofilijas DNS diagnostika: MTHFR DNS tests

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 072

73.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas G(20210)A klātbūtne gēnā F2
Trombofilijas DNS diagnostika: protrombīna DNS tests

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 073

74.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

Mutācijas G(1691)A klātbūtne gēnā F5
Faktora V Leidena trombofilijas DNS diagnostika

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), DNS sekvenēšana
ar GeneAmp PCR system 9700, ABI Prism 3100

La/ MoB 074

75.

Perifēriskās asinis, kaulu smadzenes

Filadelfijas (Ph) hromosomas noteikšana. (Filadelfijas hromosoma -bcr/abl translokācija starp 9. un 22. hromosomu)

Ph (Filadelfijas) hromosomas kvalitatīvā noteikšana, izmantojot RT-divpakāpju PCR. Reversās transkriptāzes polimerāzes ķēdes reakcija (RT-PCR), DNS fragmentu analīze, BCR-ABL mRNS detektēšana.
MT 10-011

La/ MoB 075

76.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

CFTR gēna mutācija dF508

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

 La/ MoB 076

77.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

CFTR gēna mutācija del394TT

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR)

La/ MoB 077

78.

Genoma DNS (dezoksiribo-nukleīnskābe)

SERPINA1 gēna mutācija PI Z

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi

La/ MoB 078

79.

DNS

SERPINA1 gēna mutācija PI S

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi

La/ MoB 079

80.

DNS

CX26 gēna mutācija del35G

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 080

81.

DNS

UGT1A1 gēna genotips (TA)7/(TA)7

PCR, Denaturējošā gela elektroforēze (DGE)

La/ MoB 081

82.

DNS

HFE gēna mutācija C282Y

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 082

83.

DNS

HFE gēna mutācija H63D

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 083

84.

DNS

HFE gēna mutācija S65C

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 084

85.

DNS

TFR2 gēna mutācija Y250

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR), enzimātiska šķelšana ar restrikcijas endonukleāzi (RE)

La/ MoB 085

86.

 Asinis

 DNS fragmenti

Polimerāzes ķēdes reakcija (DNS fragmentu kopiju skaita pavairošana)

La/MoB 086

87.

Perifēriskās asinis, siekalas, audi.

Donora šūnu % daudzums  recipienta asinīs

Himērisma monitorings pēc alogēnas kaulu smadzeņu vai perifērisko asiņu cilmes šūnu transplantācijas, izmantojot STR lokusu genotipēšanu. PCR, izmantojot specifiskus praimerus; DNS fragmentu analīze ar kapilāro elektroforēzi; datorizēta rezultātu apstrāde – donora/recipienta informatīvo lokusu pīķu laukumu salīdzināšana. (07-003)

La/ MoB 087

88.

Augļūdens, horija bārkstiņu bioptāts,  perifēriskās asinis, siekalas.

13., 18., 21. un dzimumhromosomu aneiploīdija cilvēka šūnās

Biežāko hromosomu patoloģiju prenatālā diagnostika, izmantojot reaģentu komplektu ChromoQuantTM . PCR, izmantojot specifiskus praimerus; DNS fragmentu analīze ar kapilāro elektroforēzi; datorizēta rezultātu apstrāde – informatīvo lokusu pīķu laukumu proporciju noteikšana. (07-004)  

La/ MoB 088

89.

Perifēriskās asinis, kaulu smadzenes

Hibrīdās BCR-ABL mRNS daudzums attiecībā pret veselās BCR un/vai ABL mRNS daudzumu.

Ph (Filadelfijas) hromosomas pozitīvu leikožu terapijas efektivitātes kontrole, izmantojot BCR/ABL gēna ekspresijas kvantitatīvu analīzi. mRNS izolēšana; kDNS sintēze; reālā laika PĶR (qPCR) ar amplifikācijas produktu daudzuma pieauguma novērošanu pēc katra amplifikācijas cikla, izmantojot produktam specifisku fluorescenti iezīmētu oligonukleotīdu zondi.
MT 10-010

La/ MoB 089

 

90.

Asins serums, plazma

Hepatīta B  vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) HBV DNS noteikšanai MT 09- 052

La/MoB 90

91.

Bioloģiskais materiāls

Citomegalovīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) CMV DNS noteikšanai

MT 09- 053

La/ MoB 91

 92.

Bioloģiskais materiāls

Herpes simplex vīrusu 1 un 2 tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) HSV ½ DNS noteikšanai

MT 09- 054

La/ MoB 92

93.

Bioloģiskais materiāls

Varicella zoster vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) VZV DNS noteikšanai

MT 09- 055

La/ MoB 93

94.

Bioloģiskais materiāls

Epšteina - Barra vīrusa DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) EBV kvantitatīvai DNS noteikšanai MT 09- 056

La/ MoB 94

95.

Bioloģiskais materiāls

Enterovīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) enterovīrusu  RNS noteikšanai MT 09- 057

La/ MoB 95

96.

Bioloģiskais materiāls

A/B gripas vīrusu RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) A/B gripas vīrusu RNS noteikšanai MT 09- 058

La/ MoB 96

97.

Bioloģiskais materiāls

A gripas vīrusu subtipi

Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) A gripas vīrusu subtipu noteikšanai

MT 09- 059

La/ MoB 97

98.

Asins plazma

HIV genotips

Sekvenēšana HIV genotipa noteikšanai

 DNS sekvenēšana

MT 09- 060

La/ MoB 98

99.

Asins leikocīti, augļa ūdens

Citomegalovīrusa DNS 

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) CMV DNS noteikšanai MT 09- 061

La/MoB 99

100.

Asins leikocīti, augļa ūdens

Herpes simplex vīrusu 1 un 2 tipu DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) HSV 1/2 noteikšanai  MT 09- 062

La/MoB 100

101.

Izkarnījumi

Norovīrusu 1,2 tipa RNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PCR) Norovīrusu ½ tipa RNS noteikšanai

 MT 09- 063

La/MoB 101

102. 

Genoma DNS; nukleotīdu sekvence (bāzu secība) HLA DQA1 un DQB1 gēnu 2. un, nepieciešamības gadījumā, arī 1. un 3. eksonā

Ar celiakiju asociēto DQA1 un DQB1 gēnu variantu (alēļu) klātbūtne

Celiakijas riska DNS tests.

- HLA DQA1 un DQB1 gēnu 1., 2. un 3. eksona amplifikācija ar polimerāzes ķēdes reakcijas (PĶR) metodi;

- PCR produktu attīrīšana ar ExoSAP;

- sekvenēšanas reakcija, izmantojot didezoksiterminātoru metodi;

- DNS fragmentu analīze ar kapilāro elektroforēzi un fluorescento iezīmju detektēšanu;

- rezultātu analīze.

MT 12-013

 La/MoB 102

 103.

Piena dziedzera vēža audi, kas iegūti operācijas vai biopsijas laikā

LSI HER-2/neu un CEP 17 attiecības noteikšana

HER-2/neu gēna amplifikācijas noteikšana, formalīnā fiksētos, parafīnā ieguldītos cilvēka krūts vēža audu paraugos, izmantojot fluorescento in situ supresijas hibridizāciju (FISH) ar neiezīmētu bloķējošo DNS.

Izmantojot PathVysion HER-2 DNA Probe Kit (PathVysion Kit).

MT 12-025

La/MoB 103

104. Bioloģiskais materiāls Chlamydia trachomatis rRNS un Neisseria gonorrhoeae rRNS Izotermiskās amplifikācijas metode Chlamydia trachomatis un Neisseria gonorrhoeae rRNS kvalitatīvai noteikšanai.

MT 14-020

La/MoB 104
105. Bioloģiskais materiāls Chlamydia trachomatis rRNS Izotermiskās amplifikācijas metode Chlamydia trachomatis rRNS kvalitatīvai noteikšanai.

MT 14-021

La/MoB 105
106. Bioloģiskais materiāls Neisseria gonorrhoeae rRNS Izotermiskās amplifikācijas metode Neisseria gonorrhoeae rRNS kvalitatīvai noteikšanai.

MT 14-022

La/MoB 106
107.
Bioloģiskais materiāls Treponema pallidum DNS  Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Treponema pallidum DNS kvalitatīvai noteikšanai ar fluorescences detekciju pēc beigu punkta („end point").

MT 14-024

 La/MoB 107
 108. Bioloģiskais materiāls Trichomonas vaginalis DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Trichomonas vaginalis DNS kvalitatīvai noteikšanai ar fluorescences detekciju pēc beigu punkta („end point").

MT 14-025

 La/MoB 108
109.
Bioloģiskais materiāls Mycoplasma pneumonia /Chlamydophila pneumoniae DNS Polimerāzes ķēdes reakcija ar fluorescences detekciju pēc beigu punkta („end point") Mycoplasma pneumonia /Chlamydophila pneumoniae DNS kvalitatīvai noteikšanai.

MT 14-026

 La/MoB 109
110. Perifēriskās asinis ar EDTA T-limfocītu imunofenotipu CD4 (absolūtais skaits, %) un CD8 (absolūtais skaits) Limfocītu imunofenotipu CD4+ un CD8+ kvantitatīva noteikšana ar citometriju. Plūsmas citometrija. MT 15-005 La/MoB 110
111. Asins plazma HIV-1 vīrusa jutība pret CCR5 receptoru antagonistiem Genotipēšana ar sekvenēšanas metodi HIV jutības pret CCR5 receptoru antagonistiem noteikšanai. MT 15-006 La/MoB 111
112. Asins plazma, ja HIV-1 vīrusa slodze >200 kop/ml HIV-1 rezistences pret antiretrovirāliem medikamentiem noteikšana Genotipēšana ar sekvenēšanas metodi HIV-1 rezistences pret antiretrovirāliem medikamentiem noteikšanai. MT 15-007 La/MoB 112
113. Vides objekts (ērces) Ērču encefalīta vīrusa (ĒEV) RNS Ērču encefalīta vīrusa (TBE) RNS ērcēs noteikšana ar RT-PĶR. MT 15-008 La/MoB 113
114. Bioloģiskais materiāls (nokasījumi no uroģenitālā ceļa gļotādas, taisnās zarnas; iztriepes no rīkles, konjunktīvas izdalījumi, urīna paraugi, prostatas sekrēts) Chlamydia trachomatis, Ureaplasma un Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium DNS Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR) Chlamydia trachomatis, Ureaplasma un Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium DNS noteikšanai. MT 15-009 La/MoB 114
115. Klīniskais materiāls (asinis plazma un serums, likvors, autopsijas materiāls, ērces) TBE RNS Polimerāzes ķēdes reakcija ar detekciju reālajā laikā (RT-PCR) ērču encefalīta vīrusa RNS noteikšanai. MT 15-011 La/MoB 115
116. Formalīnā fiksēti un parafīnā iekļauti audzēja (melanoma) audi BRAF gēna V600 mutācijas noteikšana BRAF gēna 600.kodona mutācijas noteikšana. Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā. MT 15-015 La/MoB 116
117. Klīniskais materiāls (asins, asins serums, asins plazma, cerebrospinālais šķidrums (likvors)) Dengue vīrusa RNS Denge vīrusa ribonukleīnskābes noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 15-018 La/MoB 117
118. Klīniskais materiāls (asins, asins serums, asins plazma, cerebrospinālais šķidrums (likvors)) un iepriekš izolētā RNS Dengue vīrusa tipa RNS Denge vīrusa ribonukleīnskābes tipēšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 15-020 La/MoB 118
119. Bioloģiskais materiāls (uztriepes: rīkles gala, deguna eju, aizdegunes, krēpas; bronhoalveolārās lavāžas, atsūknējumi; nazofaringeālie aspirāti) Bakteriālo pneimoniju izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis, Mycoplasma pneumoniae) DNS

Multiplex PĶR bakteriālo pneimoniju izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis, Mycoplasma pneumoniae) DNS noteikšanai.

MT 15-025 

La/MoB 119
120. Neisseria meningitidis bakteriālā kultūra Neisseria meningitidis genotips (Neisseria meningitidis porA un fetA gēni)

Neisseria meningitidis genotipēšana ar MLST (Multilocus sequence typing) metodi. 

MT 15-026

 

La/MoB 120
121. Legionella pneumophila bakteriālā kultūra Legionella pneumophila genotips

Legionella pneumophila sekvenēšana ar MLST (Multilocus sequence typing) metodi.

MT 15-027  

 

La/MoB 121
122. Šūnu kultūras Mycoplasma spp DNS

Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Mycoplasma spp. DNS noteikšanai šūnu kultūrās.

MT 15-028

La/MoB 122
123.

Bioloģiskais materiāls (lumbālpunktāts)

Bakteriālo meningītu izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza type b, Neisseria meningitidis, B grupas Streptococcus, Listeria monocytogenes) DNS

Multiplex PĶR bakteriālo meningītu izraisītāju (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenza type b, Neisseria meningitidis, B grupas Streptococcus, Listeria monocytogenes) DNS noteikšanai.

MT 15-024

La/MoB 123
124. Klīniskais materiāls (bronhu skalojums, krēpas, atsūknējumi no rīkles un trahejas, plaušu bioptāti, skalojumi un iztriepes no rīkles) Pneumocystis jirovecii (carinii) QDNS Polimerāzes ķēdes reakcija ar detekciju reālajā laikā (PĶR-RL) Pneumocystis jirovecii (carinii) DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-001. La/MoB 124
125. Bioloģiskais materiāls (krēpas (inducētas krēpas) vai atsūknējums no bronhiem, iztriepes no rīkles, žāvas, bronho alveolārais skalojums, sekcijas materiāls (bojāto plaušu daļas), mikroorganismu kultūras). Legionella pneumophila DNS Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR) Legionella pneumophila DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-002. La/MoB 125
126. Bioloģiskais materiāls (nazofaringeālas iztriepes, nazofaringeāls aspirāts, krēpas) Bordetella pertussis DNS Bordetella pertussis DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā. MT 16-003. La/MoB 126
127. Bioloģiskais materiāls (nazofaringeālas iztriepes, nazofaringeāls aspirāts, krēpas)

Bordetella parapertussis DNS


Bordetella parapertussis DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā.

MT 16-004. 


La/MoB 127
128. Klīniskais materiāls (deguna iztriepe) Meticilīna rezistenta S.aureus/S.aureus DNS

Pret meticilīnu rezistentā Staphylococcus aureus (MRSA) noteikšana no deguna iztriepēm ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR reālajā laikā).

MT 16-005.
La/MoB 128
129. Klīniskais materiāls (ādas un mīksto audu nokasījumi) Meticilīna rezistenta S.aureus/S.aureus DNS.

Pret meticilīnu rezistentā Staphylococcus aureus (MRSA) un Staphylococcus aureus noteikšana no ādas un mīkstajiem  audiem ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR reālajā laikā).

MT 16-006.
La/MoB 129
130. Klīniskais materiāls (fēces). E.coli  DNS

Enterohemorāģisko E.coli DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR).

MT 16-007.
La/MoB 130
131. Perifērās asinis ar EDTA. Cilvēka leikocitārais antigēns HLA-B*5701.

Cilvēka leikocitārā antigēna HLA-B*5701  tipēšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PĶR).

MT 16-008.
La/MoB 131
132. Klīniskais materiāls (asinis, likvors, augļu ūdeņi). Toxoplasma gondii DNS Polimerāzes ķēdes reakcija ar detekciju reālajā laikā (PĶR-RL) Toxoplasma gondii DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-009. La/MoB 132
133. Klīniskais materiāls  (krēpas, bronhu skalojumi, pleiras punktāts, likvors). M. tuberculosis DNS/ rifampicīna rezistence.

Mycobacterium tuberculosis  DNS (puskvantitatīvi) un rezistences pret rifampicīnu noteikšana.

PĶR-RL.

MT 16-010.
La/MoB 133
134. Klīniskais materiāls (asins plazma, muguras smadzeņu šķidrums); autopsijas materiāls (smadzenes, nieres, plaušu audi, aknas, mezenteriālie limfmezgli); bioloģiskais materiāls (plaušu audi, smadzenes un nieres). Leptospira spp. 16S RNS Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR) patogēno Leptospira spp. 16S RNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-016. La/MoB 134
135. Mikroorganisma izolāts - attīrīta M.tuberculsosis DNS. M. tuberculosis genotipa noteikšana pēc insercijas elementu IS6110 kopiju skaita un izvietojuma atšķirībām hromosomā. Mycobacterium tuberculosis insercijas elementu IS6110 restrikcijas fragmentu garuma polimorfisma analīze (RFLP). MT 16-018. La/MoB 135
136. Mikroorganisma izolāts - no M. tuberculosis kultūras izdalīta DNS. M.tuberculosis DNS M. tuberculosis kompleksa genotipēšana ar MIRU-VNTR tipēšanas komplektu (Genoscreen, Supply et al., 2006). MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units - Variable Number Tandem Repeat). MT 16-019. La/MoB 136
137. Vides objekts Bacillus anthracis DNS vides paraugos. Bacillus anthracis DNS noteikšana vides paraugos. Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR). MT 16-020. La/MoB 137
138. Bioloģiskais materiāls: asinis, krēpas, izdalījumi no ādas bojājumiem. Bacillus anthracis DNS. Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR-RL) Bacillus antrhacis DNS kvalitatīvai noteikšanai Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR). MT 16-021 La/MoB 138
139. Bioloģiskais materiāls: perifērās asinis, limfmezgli, punktāts no buboņa (vezikulām, karbunkuliem), krēpas, iztriepes no rīkles, žāvas, urīns, fēces, aknas, liesas audi, virsnieres, smadzenes, patoloģiski izmainīto audu un orgānu iecirkņi; vides objekti: blusas, ērces, (augsne), dzīvnieku vides objekts. Yersinia pestis DNS. Polimerāzes ķēdes reakcija ar detekciju reālajā laikā (PĶR-RL) Yersinia pestis DNS kvalitatīvai noteikšanai Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (RT-PCR). MT 16-022. La/MoB 139
140. Bioloģiskais materiāls: asins serums vai asins plazma. Burkholderia pseudomallei DNS. Burkholderia pseudomallei DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-023. La/MoB 140
141. Bioloģiskais materiāls, vides objekti: audi, asinis, ķermeņa šķīdumi, vides objekti (ērces). Francisella tularensis DNS. Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR) Francisella tularensis DNS kvalitatīvai noteikšanai. (PĶR-RL). MT 16-024. La/MoB 141
142. Klīniskais materiāls: fēces, zarnu biopsijas, intestinālais šķīdums. Cryptosporidium parvum DNS Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Cryptosporidium parvum DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-025. La/MoB 142
143. Bioloģiskais materiāls: paraugi no respiratorām izejām (iztriepes, krēpas, skalojumi, BAL), iztriepes no konjunktīvas, ķermeņa šķidrumi, aborta materiāls, fēces. Chlamydia psittaci DNS Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Chlamydia psittaci DNS kvalitatīvai noteikšanai. PĶR-RL. MT 16-026. La/MoB 143
144. Bioloģiskais materiāls: fēces, iztriepes no taisnās zarnas gļotādas, vemšanas masas, sekcijas materiāls, baktēriju kultūra. Vibrio cholerae DNS. Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR-RL) Vibrio cholerae DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-027. La/MoB 144
145. Bioloģiskais materiāls: audi, asinis, fēces, ķermeņa šķīdumi, bakteriālās kultūras; vides objekti (ūdens). Clostridium perfringens DNS. Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR) Clostridium perfringens DNS noteikšanai. MT 16-028. La/MoB 145
146. Vides objekts (ērces) Ērču encefalīta vīrusa (TBE) RNS. Ērču encefalīta vīrusa (TBE) RNS ērcēs noteikšana ar PĶR-RL. MT 16-052. La/MoB 146
147. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls – uztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., biopsijas un sekcijas materiāls, krēpas, bronhoalveolāra lavāža), kulturālais šķīdums un iepriekš izolētā RNS. B tipa gripas vīrusu līnija. B tipa gripas vīrusu līniju noteikšana ar PĶR-RL. MT 16-053 La/MoB 147
148. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls - iztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., siekalas, urīns), kulturālais šķīdums. Masalu (Rubeola) vīrusa RNS. Masalu (Rubeola) vīrusa RNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR RL). MT 16-054 La/MoB 148
149. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls - iztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., siekalas, urīns), kulturālais šķīdums. Masaliņu (Rubella) vīrusa RNS. Masaliņu (Rubella) vīrusa RNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR RL). MT 16-055 La/MoB 149
150. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls – iztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., siekalas, urīns, mutes dobuma iztriepe, cerebrospinālais šķidrums (likvors)), kulturālais šķīdums. Epidēmiskā parotīta vīrusa (Mumps) RNS. Epidēmiskā parotīta vīrusa (Mumps) RNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR RL). MT 16-056 La/MoB 150
151. Bioloģiskais materiāls (asins plazma, serums, fekālijas, ar bioloģisko materiālu piesārņots ūdens). A hepatīta vīrusa RNS A hepatīta vīrusa ribonukleīnskābes noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-057 La/MoB 151
152. Bioloģiskais materiāls (asins serums, asins plazma, fekālijas). E hepatīta vīrusa RNS E hepatīta vīrusa ribonukleīnskābes noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-058 La/MoB 152
153. Bioloģiskais materiāls (asins serums, asins plazma). G hepatīta vīrusa RNS G hepatīta vīrusa ribonukleīnskābes noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-059 La/MoB 153
154. Bioloģiskais materiāls (iztriepes no taisnās zarnas, natīvas fēces). Bakteriālo diareju izraisītāju (Clostridium perfringens, Yersinia enterocolitica, Aeromonas spp., E.coli 0157:H7, E.coli VTEC) DNS. Multiplex PĶR bakteriālo diareju izraisītāju (Clostridium perfringens, Yersinia enterocolitica, Aeromonas spp., E.coli 0157:H7, E.coli VTEC) DNS noteikšanai. MT 16-060 La/MoB 154
155. Streptococcus pneumoniae izolāts Streptococcus pneumoniae serotipa DNS Streptococcus pneumoniae serotipu noteikšana ar Multiplex PĶR. MT 16-061 La/MoB 155
156. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls: rīkles gala un deguna eju utt. iztriepes, krēpas, bronhoalveolāra lavāža, biopsijas un sekcijas materiāls), kulturālais šķīdums. Parainfluenza virus 1-3, Adenovirus A/B/C/D/E, Coronavirus 229E/NL63, Coronavirus OC43, Rhinovirus A/B/C , Influenza A virus, Respiratory syncytial virus A , Respiratory syncytial virus Bocavirus 1/2/3/4 , Influenza B virus, Metapneumovirus, Parainfluenza virus 4, Enterovirus RNS/DNS. Respspiratoro vīrusu (Parainfluenza virus 1-3, Adenovirus A/B/C/D/E, Coronavirus 229E/NL63, Coronavirus OC43 , Rhinovirus A/B/C , Influenza A virus, Respiratory syncytial virus A, Respiratory syncytial virus Bocavirus 1/2/3/4 , Influenza B virus, Metapneumovirus, Parainfluenza virus 4, Enterovirus) RNS/DNS noteikšana ar multiplex PĶR metodi. MT 16-062 La/MoB 156
157. Bioloģiskais materiāls – cerebrospinālais šķidrums (likvors). HSV 1 DNS, HSV 2 DNS, VZV DNS, EBV DNS, CMV DNS, HHV6 DNS, enterovīrusu RNS. Virusālo meningītu izraisītāju (HSV 1, HSV 2, VZV, EBV, CMV, HHV6, enterovīrusu) nukleīnskābju noteikšana ar multiplex PĶR metodi. MT 16-063 La/MoB 157
158. Bioloģiskais materiāls (klīniskais materiāls: rīkles gala un deguna eju utt. uztriepes, biopsijas un sekcijas materiāls, krēpas, bronhoalveolāra lavāža), kulturālais šķīdums un iepriekš izolētā RNS. Gripas vīrusu mutācijas asociētas ar rezistenci pret zālēm. A/H1N1 vīrusu rezistento pret oseltamivīru RNS noteikšana. Gripas vīrusu rezistences noteikšana pret oseltamivīru ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-064 La/MoB 158
159. Bioloģiskais materiāls (asinis, asinis ar EDTA, nedrīkst izmantot asinis ar heparīnu). B hepatīta vīrusa rezistence pret lamivudīnu. B hepatīta vīrusa (HBV) rezistences pret lamivudīnu noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PĶR). MT 16-065 La/MoB 159
160. Bioloģiskais materiāls, baktēriju kultūras. Meticilīna rezistenta Staphylococcus aureus (mecA gēns, nuc gēns) DNS. Meticilīna rezistenta Staphylococcus aureus DNS (mecA gēns, nuc gēns) noteikšana ar multiplex PĶR. MT 16-066 La/MoB 160
161. Mikroorganismu izolāts Neisseria meningitidis serogrupa (B, C, Y, W 135). Neisseria meningitidis serogrupu (B, C, Y un W 135) noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PĶR). MT 16-067 La/MoB 161
162. Mikroorganismu izolāts Haemophilus influenzae serotips (ompP2; VK; cap a, b, c, d, e, f gēni). Haemophilus influenzae serotipu (ompP2; VK; cap a, b, c, d, e, f) noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PĶR). MT 16-068 La/MoB 162
163. Mikroorganismu izolāts Verotoksīnproducējošo Escherichia coli (VTEC) vtx1 un vtx2 gēni. Verotoksīnproducējošo Escherichia coli (VTEC) vtx1 un vtx2 gēnu noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju (PĶR). MT 16-069 La/MoB 163
164. Bioloģiskais materiāls (perifērās asinis, sinoviālais šķidrums, limfmezglu punktāts) un mikroorganismu kultūras. Brucella spp. DNS Polimerāzes ķēdes reakcija reālajā laikā (PĶR-RL) Brucella spp. DNS kvalitatīvai noteikšanai. MT 16-071 La/MoB 164
165. Bioloģiskais materiāls (asinis, likvors). Borrelia burgdorferi DNS Borrelia burgdorferi DNS kvantitatīva noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā. MT 16-072 La/MoB 165
166. Vides objekts (ērces). Anaplasma phagocytophilum DNS. Anaplasma phagocytophilum DNS noteikšana ērcēs ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-073 La/MoB 166
167. Bioloģiskais materiāls (uztriepe no deguna starpsienas, nokasījums no ādas, asins plazma). Mycobacterium leprae DNS Mycobacterium leprae DNS noteikšana ar polimerāzes ķēdes reakciju reālajā laikā (PĶR-RL). MT 16-074 La/MoB 167
168. Vides objekts (ērces)

Borrelia spp. DNS

Borrelia DNS noteikšana ar molekulāras hibridizācijas metodi.

MT 16-078
La/MoB 168
169. Vides objekts (ērces)

Babesia  spp. DNS

Babesia  DNS noteikšana ar molekulāras hibridizācijas metodi.

MT 16-079
La/MoB 169
170. Mikroorganismu izolāts Salmonella spp. genotipēšana

Salmonella spp. genotipēšana

ar gēla elektroforēzes pulsējošā laukā metodi

 (Pulse Field Gel Electrophoresis - PFGE).

MT 16-080
La/MoB 170
171. Mikroorganismu izolāts Listeria monocytogenes genotipēšana

Listeria monocytogenes genotipēšana ar

Pulse Field Gel Electrophoresis (PFGE). MT 16-081
La/MoB 171
172. M. tuberculsosis mikroorganismu izolāts M.tuberculosis DNS spoligotipēšana

M. tuberculosis DNS starpfragmentu oligonukleotīdu genotipēšanas (Spoligotipēšanas) metode.

MT 16-082
La/MoB 172
173. Bioloģiskais materiāls (uztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., biopsijas un sekcijas materiāls, gripas kultūras, krēpas, bronhoalveolāra lavāža) un iepriekš izolētā RNS Gripas vīrusu mutācijas asociētas ar rezistenci pret zālēm

Gripas vīrusu rezistences noteikšana

ar sekvenēšanas metodi.

MT 16-083
La/MoB 173
174. Bioloģiskais materiāls (iztriepes: rīkles gala un deguna eju utt., siekalas, urīns), masalas kultūras vai iepriekš izdalītā RNS Masalu (Rubeola) vīrusa genotips

Masalu (Rubeola) vīrusa genotipēšana ar sekvenēšanu.

MT 16-084
La/MoB 174

Aktualizēts: 16.05.2017.